17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0351 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1315    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000201568  normal  0.805939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1178  hypothetical protein  31.27 
 
 		 673 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3491  hypothetical protein  33.45 
 
 		 651 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3802  hypothetical protein  33.54 
 
 		 651 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000317632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0298  hypothetical protein  30.71 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000564529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  30.78 
 
 		 662 aa  263  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000629904  normal  0.50337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3690  hypothetical protein  30.16 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000260745  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0004  hypothetical protein  32.95 
 
 		 660 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0338  hypothetical protein  32.71 
 
 		 651 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000473528  normal  0.110861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0056  hypothetical protein  30.83 
 
 		 660 aa  259  9e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00640513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3623  hypothetical protein  32.25 
 
 		 651 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1858  hypothetical protein  32.3 
 
 		 660 aa  257  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153141  normal  0.576375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2943  hypothetical protein  29.51 
 
 		 659 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  22.92 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  20.9 
 
 		 635 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  22.25 
 
 		 800 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.72 
 
 		 903 aa  43.9  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>