242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3513 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 376 aa  779    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  55.86 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  53.24 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  54.3 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  53.55 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  52.17 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  51.66 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  44.47 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  42.16 
 
 		 383 aa  271  9e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  38.98 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  37.27 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  38.03 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  35.26 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  37 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.9 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.53 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 387 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.13 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  38.76 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.51 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.51 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  38.25 
 
 		 375 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.75 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.57 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.61 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  32.61 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  35.2 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.79 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  35.8 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.79 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  37.27 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  32.84 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  32.35 
 
 		 380 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.2 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.62 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.35 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.44 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  34.71 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.63 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.71 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>