More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5462 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  94.63 
 
 		 244 aa  470  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  95.04 
 
 		 244 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  87.97 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  86.72 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  74.69 
 
 		 245 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  71.02 
 
 		 245 aa  358  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  71.37 
 
 		 248 aa  358  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  71.84 
 
 		 245 aa  357  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  71.43 
 
 		 245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  71.31 
 
 		 249 aa  351  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  70.9 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  70.9 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  67.63 
 
 		 242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  67.36 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  66.53 
 
 		 246 aa  331  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  66.53 
 
 		 241 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  66.53 
 
 		 241 aa  324  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  64.32 
 
 		 243 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  65.29 
 
 		 255 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  64.32 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  64.32 
 
 		 261 aa  318  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  64.32 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.32 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  64.32 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.49 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  64.32 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  64.05 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  63.07 
 
 		 243 aa  314  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  62.92 
 
 		 252 aa  307  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  64.35 
 
 		 506 aa  304  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  62.92 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  59.41 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59.83 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  60.09 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  58.8 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.67 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.9 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 		 248 aa  274  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.91 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.02 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.83 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.6 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.97 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.51 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.25 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.97 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.3 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.36 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  56.49 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.5 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.72 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  56.3 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.39 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.36 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.36 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  52.74 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.14 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  52.92 
 
 		 259 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  55.6 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  58.62 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  56.36 
 
 		 258 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  53.36 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  52.42 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  53.81 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.65 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.11 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.97 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.11 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.67 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  52.7 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  54.73 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>