More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1574 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1574  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0374767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  28.86 
 
 		 268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 283 aa  99.4  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 283 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 293 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 283 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  30.19 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 293 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.49 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 292 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 256 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 279 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 293 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 293 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 297 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 262 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 273 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.56 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 311 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 		 278 aa  92.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 450 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 262 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  31.48 
 
 		 296 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  30.99 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 255 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 294 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 257 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 264 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 249 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 267 aa  88.2  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 260 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 280 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 291 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 280 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 279 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 286 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 259 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 272 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 257 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 272 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 275 aa  85.1  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>