More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0870 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0870  putative secretion pathway protein  100 
 
 		 606 aa  1237    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  31.23 
 
 		 686 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  31.07 
 
 		 767 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.78 
 
 		 745 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  29.55 
 
 		 546 aa  102  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.89 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.89 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.89 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  26.62 
 
 		 763 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  30.27 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.92 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  28.87 
 
 		 793 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  29.39 
 
 		 641 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.37 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  29.38 
 
 		 748 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  29.54 
 
 		 537 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  24.46 
 
 		 819 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.5 
 
 		 567 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.62 
 
 		 776 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.12 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.12 
 
 		 559 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.37 
 
 		 556 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.02 
 
 		 550 aa  94.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.9 
 
 		 559 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.9 
 
 		 559 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.66 
 
 		 556 aa  93.6  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  28.2 
 
 		 881 aa  93.6  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.94 
 
 		 829 aa  93.6  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  25.08 
 
 		 797 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.5 
 
 		 563 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  27.83 
 
 		 658 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  26.59 
 
 		 720 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  29.01 
 
 		 561 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  28.77 
 
 		 422 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  27.64 
 
 		 559 aa  92  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  28.9 
 
 		 549 aa  90.5  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  26.3 
 
 		 554 aa  90.1  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  25.08 
 
 		 718 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  26.2 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  26.01 
 
 		 833 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  27.37 
 
 		 915 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  32.97 
 
 		 648 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 794 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  26.3 
 
 		 544 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 645 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.46 
 
 		 1421 aa  87.4  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  28.03 
 
 		 776 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 		 692 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.02 
 
 		 689 aa  87.4  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  25.94 
 
 		 747 aa  87  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 758 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  25.09 
 
 		 711 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.24 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  26.69 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  23.82 
 
 		 751 aa  85.5  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  27.86 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 793 aa  84.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 635 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  30.26 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 		 812 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  28.63 
 
 		 787 aa  84  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  26.25 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  24.29 
 
 		 1282 aa  83.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  25.68 
 
 		 702 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  26.53 
 
 		 420 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.47 
 
 		 636 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  24.5 
 
 		 904 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.78 
 
 		 781 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 902 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  29.03 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  28.78 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  25.58 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  26.3 
 
 		 1282 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  28.32 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.98 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  24.85 
 
 		 706 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  22.3 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.21 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 946 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  25.87 
 
 		 658 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  24.91 
 
 		 696 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  23.76 
 
 		 681 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 926 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  23.51 
 
 		 736 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  24.25 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  24.21 
 
 		 640 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  24.21 
 
 		 640 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  25.09 
 
 		 569 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  24.21 
 
 		 640 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  24.62 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  29.03 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  29.33 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  27.96 
 
 		 697 aa  78.2  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  27.59 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>