More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0500 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  47.45 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  49.27 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  51.49 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  48.93 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  46.18 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  42.34 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  34.44 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  33.58 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  33.46 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  31.7 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  33.94 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  31.23 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  29.63 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  30.63 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  30.48 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  29.23 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31.2 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.11 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  30.04 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.79 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  28.47 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  30.5 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.08 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.14 
 
 		 272 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  29.52 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  30.74 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  30.63 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  29.33 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  31.95 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  28.36 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  29.6 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  29.86 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  29.37 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  29.5 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.1 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  28.46 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.1 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.43 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.13 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.04 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.19 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.5 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.26 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.37 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.98 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.38 
 
 		 189 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.88 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.82 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  26.79 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  26.19 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  26.14 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.08 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.17 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.43 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.72 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.03 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.04 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  24.08 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  24.28 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  32.12 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  32.12 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.89 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.07 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.75 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 167 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  27.97 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.07 
 
 		 172 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  28.17 
 
 		 182 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  31.36 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.75 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 57 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  26.14 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.49 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.27 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.19 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 597 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1350  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.26 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.34 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  22.22 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 62 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  41.38 
 
 		 507 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 597 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.16 
 
 		 171 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 577 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17130  4Fe-4S protein  27.45 
 
 		 516 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.29858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.17 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 314 aa  48.9  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  38.89 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.81 
 
 		 840 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  39.29 
 
 		 501 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.96 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  32.81 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  42.59 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  38.89 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>