More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1397 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  56.9 
 
 
602 aa  726    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  57.7 
 
 
623 aa  702    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  56.2 
 
 
640 aa  698    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  54.62 
 
 
591 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  57.43 
 
 
596 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.97 
 
 
677 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  56.35 
 
 
597 aa  733    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  55.95 
 
 
629 aa  673    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  57.36 
 
 
624 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  57.29 
 
 
595 aa  721    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  55.86 
 
 
641 aa  677    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  57.94 
 
 
598 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  51.07 
 
 
656 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  56.9 
 
 
596 aa  723    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  53.99 
 
 
593 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  54.82 
 
 
593 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  55.56 
 
 
590 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.12 
 
 
597 aa  716    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  52.84 
 
 
626 aa  646    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  58.02 
 
 
607 aa  738    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  57.24 
 
 
636 aa  704    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  60.17 
 
 
597 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  56.57 
 
 
617 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  58.14 
 
 
596 aa  721    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  54.73 
 
 
635 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  55.46 
 
 
591 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  55.74 
 
 
640 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  56.8 
 
 
623 aa  693    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  62.01 
 
 
592 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  55.08 
 
 
610 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  55.39 
 
 
627 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
597 aa  1225    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  61.24 
 
 
600 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  58.14 
 
 
597 aa  733    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  55.1 
 
 
588 aa  676    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  54.65 
 
 
624 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  58.14 
 
 
594 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  56.07 
 
 
619 aa  688    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.65 
 
 
593 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  54.49 
 
 
623 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  54.71 
 
 
590 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 
624 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  57.05 
 
 
636 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  53.85 
 
 
604 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  54.15 
 
 
614 aa  688    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  56.27 
 
 
614 aa  721    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  56.93 
 
 
626 aa  696    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  52.17 
 
 
632 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  57.22 
 
 
603 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  56.63 
 
 
626 aa  693    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  53.34 
 
 
626 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  58.02 
 
 
607 aa  738    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  52.09 
 
 
623 aa  633  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  56.04 
 
 
619 aa  634  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  54.82 
 
 
612 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  53.81 
 
 
628 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  57.89 
 
 
572 aa  628  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  50.5 
 
 
620 aa  624  1e-177  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  51.08 
 
 
594 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  52.07 
 
 
604 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  54.34 
 
 
572 aa  618  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  57.88 
 
 
488 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  57.11 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  52.12 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  57.11 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  57.11 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  55.75 
 
 
575 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  53.75 
 
 
552 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  59.58 
 
 
485 aa  597  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  59.01 
 
 
488 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  56.58 
 
 
569 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  53.33 
 
 
570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  49 
 
 
620 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  51.34 
 
 
562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  50.85 
 
 
570 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
634 aa  570  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  51.62 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  51.62 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  51.32 
 
 
526 aa  558  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  51.92 
 
 
535 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
569 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  53.49 
 
 
537 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  52.22 
 
 
530 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  52.79 
 
 
532 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  47.4 
 
 
545 aa  545  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  52.9 
 
 
539 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  51.42 
 
 
535 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  50.1 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  53.12 
 
 
668 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  51.12 
 
 
572 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  52.41 
 
 
543 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  52.01 
 
 
534 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  49.63 
 
 
571 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 
545 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  48.11 
 
 
545 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  50.09 
 
 
562 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
538 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  48.05 
 
 
580 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  46.59 
 
 
539 aa  491  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3090  putative formate dehydrogenase beta subunit  44.87 
 
 
518 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>