151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4037 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  83.91 
 
 		 230 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  24.43 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  27.44 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  25.98 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  24.51 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  26.19 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  22.52 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  21.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 427 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 550 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  23.47 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.63 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  38.98 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  21.83 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.81 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.39 
 
 		 1019 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  30.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  42.37 
 
 		 914 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 1013 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  38.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  35.14 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.21 
 
 		 914 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  37.68 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  41.3 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 895 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  22.57 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  38.71 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 515 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 489 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  43.14 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.3 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  35.48 
 
 		 596 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  25 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5898  transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>