162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0679 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  996    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15131  exodeoxyribonuclease V  97.54 
 
 		 448 aa  900    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  58.33 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  59.87 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  58.35 
 
 		 481 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  56.43 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  29.69 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  28.33 
 
 		 678 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  22.54 
 
 		 754 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  31.79 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  25.4 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  26.76 
 
 		 924 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  26.76 
 
 		 924 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 367 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  23.79 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  32.98 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  30.26 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  30.26 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  30.41 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  28.71 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  22.47 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  28.8 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  29.35 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  28.64 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.12 
 
 		 659 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  26.62 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  27.14 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  27.49 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  28.23 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  31.41 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  29.35 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  29.63 
 
 		 761 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  28.23 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  27.97 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  26.99 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  31.37 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  27.45 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  27.18 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  28.37 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.86 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  30.15 
 
 		 1214 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  27.18 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.81 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  28.18 
 
 		 749 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.75 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  22.76 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  26.34 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  27.88 
 
 		 369 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  30.99 
 
 		 720 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  27.88 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.65 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  25 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  28.39 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  27.84 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  27.72 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  30.43 
 
 		 768 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  27.4 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  25.47 
 
 		 726 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.84 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.32 
 
 		 739 aa  54.7  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.08 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  22.44 
 
 		 733 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.13 
 
 		 907 aa  53.5  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  31.33 
 
 		 744 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  29.45 
 
 		 722 aa  53.5  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  31.9 
 
 		 743 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.32 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  31.33 
 
 		 744 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  34.65 
 
 		 795 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.05 
 
 		 744 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  30.12 
 
 		 742 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.03 
 
 		 746 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  28.21 
 
 		 946 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  31.25 
 
 		 750 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  26.69 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  35.46 
 
 		 792 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  27.42 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  32.76 
 
 		 726 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  34.29 
 
 		 728 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  31.52 
 
 		 737 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  29.52 
 
 		 776 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  31.28 
 
 		 749 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3625  AAA ATPase  26.22 
 
 		 511 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  30.46 
 
 		 373 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.63 
 
 		 698 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  30.91 
 
 		 698 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  28.7 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  29.94 
 
 		 740 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3010  AAA ATPase  26.06 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  33.56 
 
 		 825 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  30.11 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  30.67 
 
 		 749 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  29.5 
 
 		 1112 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  28.79 
 
 		 730 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  30.81 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.43 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>