More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82202 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  60.99 
 
 		 1072 aa  843    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  100 
 
 		 997 aa  2018    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  57.32 
 
 		 1228 aa  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  52.46 
 
 		 623 aa  653    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  50.41 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  38.9 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  38.49 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  37.81 
 
 		 599 aa  369  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  36.08 
 
 		 589 aa  363  9e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  37.89 
 
 		 602 aa  363  9e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  38 
 
 		 597 aa  362  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  35.54 
 
 		 593 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  37.28 
 
 		 607 aa  355  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  38.33 
 
 		 594 aa  353  8e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  37.72 
 
 		 604 aa  346  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  34.55 
 
 		 591 aa  344  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  36.2 
 
 		 597 aa  343  9e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  37.39 
 
 		 604 aa  341  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  36.62 
 
 		 591 aa  340  9e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  37.83 
 
 		 593 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  36.13 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  37.4 
 
 		 598 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  36 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  37.2 
 
 		 598 aa  328  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  40.32 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  34.59 
 
 		 588 aa  325  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  36.53 
 
 		 593 aa  325  4e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  33.1 
 
 		 589 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  35.39 
 
 		 592 aa  320  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  35.31 
 
 		 598 aa  318  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  34.91 
 
 		 602 aa  318  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  34.58 
 
 		 592 aa  316  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  35.4 
 
 		 600 aa  311  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  28.94 
 
 		 962 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  27.55 
 
 		 882 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  28.52 
 
 		 905 aa  158  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  27.8 
 
 		 908 aa  156  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  27.8 
 
 		 908 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.91 
 
 		 903 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  28.06 
 
 		 1113 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  27.79 
 
 		 903 aa  153  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 		 656 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  26.43 
 
 		 914 aa  151  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  27.57 
 
 		 885 aa  151  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.18 
 
 		 1030 aa  151  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  27.45 
 
 		 880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 985 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.19 
 
 		 1183 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 1104 aa  150  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  27.14 
 
 		 838 aa  149  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  29 
 
 		 1183 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  29.33 
 
 		 854 aa  148  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  30.15 
 
 		 992 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  30 
 
 		 992 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  26.8 
 
 		 949 aa  147  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  28.18 
 
 		 1124 aa  147  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  28.66 
 
 		 1176 aa  147  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  27.72 
 
 		 882 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 970 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  27.68 
 
 		 871 aa  145  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  27.68 
 
 		 854 aa  145  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  27.61 
 
 		 896 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  27.49 
 
 		 871 aa  144  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 692 aa  144  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  27.37 
 
 		 990 aa  144  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 601 aa  144  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  27.15 
 
 		 877 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.71 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  29.54 
 
 		 1101 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  28.07 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  27.14 
 
 		 959 aa  142  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  26.42 
 
 		 831 aa  141  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  27.14 
 
 		 964 aa  141  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  28.63 
 
 		 885 aa  141  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  27.24 
 
 		 917 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  27.68 
 
 		 999 aa  140  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  26.12 
 
 		 921 aa  140  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  27.89 
 
 		 845 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  25.98 
 
 		 896 aa  140  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  28.22 
 
 		 997 aa  140  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  26.47 
 
 		 889 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  26.28 
 
 		 1079 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  27.07 
 
 		 887 aa  140  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  27.47 
 
 		 995 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  28.24 
 
 		 700 aa  140  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  26.99 
 
 		 887 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  27.47 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  27.16 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  26.82 
 
 		 880 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  28.08 
 
 		 843 aa  140  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  26.6 
 
 		 1011 aa  140  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  26.08 
 
 		 845 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  27.53 
 
 		 854 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  28.07 
 
 		 897 aa  139  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  27.05 
 
 		 917 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  27.86 
 
 		 690 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  26.91 
 
 		 879 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  26.18 
 
 		 868 aa  137  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  25.81 
 
 		 922 aa  137  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  25.78 
 
 		 896 aa  137  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>