More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66638 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  100 
 
 
815 aa  1629    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  56.21 
 
 
1101 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 
810 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85888  transcription factor which mediates glucose repression  25.25 
 
 
669 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
878 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
1276 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.5 
 
 
1676 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 
632 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
833 aa  90.5  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
375 aa  90.5  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
3145 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.83 
 
 
784 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
288 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
1049 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
927 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.92 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.43 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
393 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
562 aa  80.9  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.76 
 
 
676 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
393 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
395 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
3172 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
1737 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.68 
 
 
936 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.78 
 
 
887 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.47 
 
 
397 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
685 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
4079 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  20.54 
 
 
409 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.85 
 
 
1979 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
3301 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 
2240 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
1252 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.83 
 
 
818 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
1252 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
711 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.34 
 
 
730 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
750 aa  71.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.81 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 
1694 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
649 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.94 
 
 
837 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.92 
 
 
1138 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
808 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 
520 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
265 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
2262 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.72 
 
 
1022 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
767 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.81 
 
 
832 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 
1056 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.5 
 
 
863 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.19 
 
 
875 aa  67.4  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
566 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
465 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
363 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
909 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
1297 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.71 
 
 
784 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.6 
 
 
725 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.8 
 
 
733 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
1067 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
234 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
361 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
1486 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
448 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
404 aa  65.1  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  23.78 
 
 
545 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
750 aa  64.3  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 
988 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  30.2 
 
 
258 aa  64.3  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.07 
 
 
635 aa  64.3  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
311 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
471 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
643 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  30.65 
 
 
407 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  25.82 
 
 
615 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 
689 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 
643 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.11 
 
 
594 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 
321 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 
373 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.28 
 
 
292 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.27 
 
 
252 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.99 
 
 
979 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>