102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  92.57 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  86.49 
 
 		 148 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  70.63 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  67.81 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  67.81 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  67.81 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  66.44 
 
 		 160 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  59.57 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  57.45 
 
 		 334 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  57.45 
 
 		 332 aa  186  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  57.93 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  56.74 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  55.17 
 
 		 335 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  55.17 
 
 		 329 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 		 144 aa  129  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 		 152 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  42.21 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  42.18 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.27 
 
 		 167 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  42.02 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  35.11 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.64 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  38.58 
 
 		 301 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 295 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  39.5 
 
 		 319 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  31.93 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  25.4 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.61 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  33.02 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  29.08 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25.98 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  25.85 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25.98 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 233 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  26.95 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  30.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  30.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  30.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  26.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.13 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.01 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.05 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.61 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.37 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  27.52 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.04 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  27.61 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.14 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  27.45 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.43 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  27.03 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  26.67 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  27.81 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  27.81 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  25.96 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  24.31 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>