More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  97.73 
 
 		 352 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 352 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  52.56 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  49.43 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 352 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  51.99 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  51.42 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  52.82 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  52.27 
 
 		 352 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  52.27 
 
 		 352 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  52.56 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  51.82 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  51.99 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  49.44 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  45.35 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  34.76 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  35.49 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  35.35 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  30.06 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  35.46 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  37.07 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.26 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  34.51 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  30.25 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  37.29 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  37.29 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  33.52 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  29.36 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  33.1 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.05 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  32.08 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  23.62 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.81 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  29.28 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  29.28 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  29.28 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.28 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  29.48 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  30.12 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  33.87 
 
 		 383 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  28.79 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  29.9 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  29.9 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  29.58 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  29.9 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  30.45 
 
 		 293 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  32.57 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  29.9 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  29.58 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  29.58 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  29.58 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  29.91 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.41 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  23.7 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  32.01 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  32.51 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  30.99 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  33.22 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  32.91 
 
 		 284 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  26.02 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.36 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  31.56 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  29.72 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 422 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  30.74 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  30.21 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  31.1 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 378 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 378 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>