More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24441 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 677 aa  1352    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  47.28 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  46.06 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  28.59 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  28.27 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  27.57 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  30 
 
 		 690 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  26.28 
 
 		 724 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  28.45 
 
 		 729 aa  181  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  28.8 
 
 		 735 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  27.94 
 
 		 731 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  30.93 
 
 		 643 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 719 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 		 721 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  26.51 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.62 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 776 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  41.33 
 
 		 748 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.91 
 
 		 576 aa  108  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.88 
 
 		 747 aa  107  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  26.61 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  26.61 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  30.65 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.65 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 197 aa  104  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.49 
 
 		 788 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  28.6 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  44.67 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 		 757 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 642 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 641 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 649 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  46.67 
 
 		 657 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 661 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 		 797 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.5 
 
 		 709 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  46.67 
 
 		 642 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 677 aa  99  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  45.52 
 
 		 642 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.14 
 
 		 669 aa  98.2  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  44.03 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.67 
 
 		 651 aa  97.8  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 649 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  40.69 
 
 		 616 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  31.61 
 
 		 642 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 		 643 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 641 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 644 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  28.71 
 
 		 698 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 574 aa  95.1  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 		 673 aa  94.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.86 
 
 		 638 aa  94.4  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 756 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.39 
 
 		 798 aa  94.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 645 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 645 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 645 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.49 
 
 		 709 aa  94  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 645 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 645 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 661 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  43.22 
 
 		 179 aa  92.8  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  27.95 
 
 		 661 aa  92.8  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 190 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  37.67 
 
 		 639 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  37.67 
 
 		 639 aa  92.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  37.67 
 
 		 639 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  38.93 
 
 		 643 aa  91.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.23 
 
 		 649 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 690 aa  92  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  39.72 
 
 		 642 aa  91.3  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  41.09 
 
 		 649 aa  91.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 649 aa  91.3  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 643 aa  91.3  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  43.09 
 
 		 648 aa  90.5  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 		 655 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  24.78 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 199 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 750 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.53 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  29.94 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 750 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.71 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  35.81 
 
 		 655 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  39.69 
 
 		 374 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  39.29 
 
 		 645 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>