119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4679 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1367 aa  2753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.28 
 
 		 927 aa  91.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  26.29 
 
 		 751 aa  89.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  23.79 
 
 		 918 aa  86.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  25.67 
 
 		 771 aa  85.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  26.45 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  23.85 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  27.25 
 
 		 806 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  25.37 
 
 		 764 aa  77  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  23.72 
 
 		 924 aa  76.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  23.13 
 
 		 781 aa  71.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  25.35 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  24.89 
 
 		 763 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  30.41 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  24.67 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  23.2 
 
 		 760 aa  65.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  43.48 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  32 
 
 		 1309 aa  61.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  23.25 
 
 		 825 aa  60.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36 
 
 		 1057 aa  59.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  43.33 
 
 		 943 aa  58.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  23.39 
 
 		 936 aa  58.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  23.06 
 
 		 935 aa  58.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  25.98 
 
 		 768 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  23.77 
 
 		 796 aa  57  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  29.38 
 
 		 1028 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  29.38 
 
 		 1096 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.07 
 
 		 945 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  45.56 
 
 		 884 aa  56.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  33.67 
 
 		 1104 aa  55.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  33.67 
 
 		 1104 aa  55.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.56 
 
 		 639 aa  55.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  32.43 
 
 		 775 aa  55.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  32.06 
 
 		 633 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  44.68 
 
 		 2066 aa  54.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  23.19 
 
 		 799 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  36.46 
 
 		 623 aa  55.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  23.4 
 
 		 856 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1916 aa  53.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  40.7 
 
 		 873 aa  53.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  22.38 
 
 		 951 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  22.68 
 
 		 938 aa  53.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1700  PKD domain containing protein  37.11 
 
 		 724 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0653279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.22 
 
 		 836 aa  53.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  53.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 1601 aa  52.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  39.33 
 
 		 1143 aa  52.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.33 
 
 		 1200 aa  52  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  23.33 
 
 		 799 aa  51.6  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  34.19 
 
 		 861 aa  52  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  23.33 
 
 		 799 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  36.96 
 
 		 811 aa  51.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  24.41 
 
 		 951 aa  51.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  23.05 
 
 		 1045 aa  51.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  52.73 
 
 		 771 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 1084 aa  50.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  23.04 
 
 		 799 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  31.62 
 
 		 666 aa  50.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.73 
 
 		 792 aa  50.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48.08 
 
 		 601 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  41.94 
 
 		 400 aa  49.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  41.35 
 
 		 999 aa  49.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  41.35 
 
 		 999 aa  49.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 1081 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  41.84 
 
 		 1029 aa  49.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  22.27 
 
 		 794 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  39.77 
 
 		 734 aa  49.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  23.57 
 
 		 796 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  34.17 
 
 		 777 aa  48.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  21.81 
 
 		 794 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  45.76 
 
 		 540 aa  48.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  37.5 
 
 		 1011 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  40.38 
 
 		 999 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  46.43 
 
 		 639 aa  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  42.31 
 
 		 840 aa  48.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3903  PKD domain containing protein  46.03 
 
 		 644 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  30.5 
 
 		 1771 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  25.12 
 
 		 566 aa  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.34 
 
 		 835 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  34.62 
 
 		 677 aa  47.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  22.27 
 
 		 812 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35 
 
 		 3197 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.16 
 
 		 1667 aa  47.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  41.33 
 
 		 687 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  34.83 
 
 		 909 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  42.65 
 
 		 317 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  36.7 
 
 		 1050 aa  47.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 1565 aa  47.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  37.25 
 
 		 814 aa  47.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  23.8 
 
 		 795 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  41.38 
 
 		 1150 aa  47  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 461 aa  46.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 917 aa  46.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 687 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.1 
 
 		 1387 aa  46.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  49.02 
 
 		 487 aa  46.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>