120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1593 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 184 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  60.33 
 
 		 368 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  35.16 
 
 		 492 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  33.7 
 
 		 498 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  34.88 
 
 		 439 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.11 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.23 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.08 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  28.92 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.55 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  27.39 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  32.69 
 
 		 414 aa  68.2  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  28.76 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 395 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.48 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  27.68 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.2 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 395 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.43 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  25.52 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  28.23 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.25 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.21 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.6 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.95 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.07 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  30.61 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.68 
 
 		 381 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.2 
 
 		 477 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.72 
 
 		 392 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  24.31 
 
 		 399 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  28.03 
 
 		 447 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  28.07 
 
 		 369 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.24 
 
 		 325 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.53 
 
 		 390 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.27 
 
 		 393 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  29.03 
 
 		 509 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.67 
 
 		 359 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1616  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.931183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.806323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.71 
 
 		 378 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 435 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.39 
 
 		 409 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  24.68 
 
 		 370 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 391 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  29.7 
 
 		 456 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.62 
 
 		 443 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  29.7 
 
 		 451 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.85 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 451 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 451 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 368 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.93 
 
 		 396 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.57 
 
 		 400 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.79 
 
 		 389 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 379 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.36 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 378 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 373 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.43 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.17 
 
 		 338 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  28.57 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.36 
 
 		 381 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.36 
 
 		 381 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25 
 
 		 370 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.71 
 
 		 357 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 387 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 402 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.56 
 
 		 371 aa  44.7  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 416 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 385 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  25.49 
 
 		 288 aa  44.7  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.76 
 
 		 453 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  31.17 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 409 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  28.57 
 
 		 401 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 298 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.58 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  32.86 
 
 		 274 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.2 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.86 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  31.25 
 
 		 418 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  27.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.53 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.08 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  27.63 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 376 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 451 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>