98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1088 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  41.62 
 
 		 186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  26.78 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  34.04 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  30.15 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  35.8 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  27.91 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.59 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  22.76 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>