132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3873 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 463 aa  950    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.32 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  19.64 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.07 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.33 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.75 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.88 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  22.95 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.68 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 556 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 520 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.34 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.52 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.46 
 
 		 559 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.72 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.45 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.45 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.45 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  21.45 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.11 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.5 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>