106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2457 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
514 aa  1004    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 
499 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
489 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
492 aa  94.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.93 
 
 
517 aa  90.5  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 
539 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
495 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.6 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
488 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 
482 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 
458 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1738  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
514 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.405975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.52 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
423 aa  61.6  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 
488 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
447 aa  60.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
480 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
453 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 
455 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
460 aa  57.4  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
441 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 
486 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.79 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  21.43 
 
 
513 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  22.54 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 
475 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
461 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
421 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 
444 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  22.75 
 
 
520 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
465 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 
463 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
475 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
444 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.91 
 
 
495 aa  53.5  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
429 aa  53.5  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.08 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
471 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
504 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
466 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
529 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
503 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.42 
 
 
488 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
479 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.31 
 
 
483 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.55 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  21.7 
 
 
458 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  21.83 
 
 
516 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 
500 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
425 aa  47.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
442 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  18.55 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0098  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.94 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.29 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
474 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 
481 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
492 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 
475 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
484 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.35 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
489 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
582 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>