33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1738 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1738  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 514 aa  960    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.405975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  25.5 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 415 aa  47  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  30.34 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  34.29 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.51 
 
 		 510 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 424 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 483 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  26.67 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>