More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1980 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  75.28 
 
 		 836 aa  847    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  100 
 
 		 829 aa  1672    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  87.71 
 
 		 820 aa  1442    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  65.65 
 
 		 851 aa  1082    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  44.76 
 
 		 769 aa  698    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  65.31 
 
 		 833 aa  1073    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  38.83 
 
 		 763 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  47.76 
 
 		 749 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  44.83 
 
 		 938 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  33.54 
 
 		 749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  33.5 
 
 		 749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  33.54 
 
 		 751 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  45.4 
 
 		 745 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  32.97 
 
 		 776 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  43.37 
 
 		 750 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  31.52 
 
 		 808 aa  431  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  43.5 
 
 		 754 aa  427  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  44.42 
 
 		 751 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.8 
 
 		 756 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 502 aa  267  5.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  31.72 
 
 		 1565 aa  218  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  26.73 
 
 		 971 aa  202  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  28.22 
 
 		 941 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 1528 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  27.76 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  37.68 
 
 		 217 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  32.26 
 
 		 216 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  31.92 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  32.57 
 
 		 233 aa  95.9  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  31.46 
 
 		 212 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  31.46 
 
 		 212 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  30.33 
 
 		 212 aa  95.5  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  30.49 
 
 		 234 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.25 
 
 		 228 aa  90.9  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  29.11 
 
 		 212 aa  87.8  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  33.18 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  29.41 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  31.42 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32.22 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  34.64 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  31.85 
 
 		 211 aa  70.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  32.22 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  36.23 
 
 		 346 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.27 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.84 
 
 		 422 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.15 
 
 		 405 aa  64.3  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  38.37 
 
 		 975 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 413 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  30 
 
 		 668 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  38.71 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  34.19 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.83 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.28 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15057  predicted protein  35.94 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  39.53 
 
 		 564 aa  62  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.49 
 
 		 433 aa  62  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 433 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  30.39 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.66 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0610  DEAD/DEAH box helicase-like  27.59 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2928  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1501  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.88 
 
 		 456 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.14 
 
 		 485 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  36.08 
 
 		 722 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.37 
 
 		 505 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  36.97 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  36.36 
 
 		 822 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.14 
 
 		 485 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2752  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 461 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 461 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2800  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0135587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  34.65 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  28.47 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.82 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.82 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  28.66 
 
 		 1269 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1327  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3021  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.88 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1337  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  34.67 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1363  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1538  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.06 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.1 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3005  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  27.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>