More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1040 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  100 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  74.38 
 
 		 281 aa  431  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  70.04 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  69.75 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  70.46 
 
 		 295 aa  358  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  30.33 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34.47 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  28.63 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  27.85 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.82 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.86 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  25.61 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.95 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.89 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.2 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.3 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  39.16 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.79 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.29 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.61 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.04 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  26.91 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.05 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.13 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  31.54 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  29.79 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.43 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  29.79 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  27.57 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.83 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.92 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.61 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.46 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.02 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.44 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.56 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  30.47 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  23.95 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.51 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.63 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  24.67 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.78 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  23.6 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.13 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.44 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  29.45 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.51 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  26.27 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  40.26 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  26.96 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.81 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.03 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  36.28 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  24.43 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  40.26 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  26.28 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.83 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.58 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.43 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  20.8 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.61 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.07 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  25 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.41 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  30.04 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  28.12 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  32.41 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.48 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.47 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  27.46 
 
 		 148 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  28.15 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>