More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3399 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4177  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>