84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2467 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 273 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.07 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.16 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 612 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  30.89 
 
 		 572 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30.89 
 
 		 572 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  46.59 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.28 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  41.51 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 572 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  38.38 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 664 aa  69.3  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  38.38 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  40.59 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  26.36 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  38.83 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 644 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  40.26 
 
 		 667 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.18 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  25.22 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  25.1 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  44.16 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  33.71 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  37.66 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  38.55 
 
 		 679 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 653 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 690 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 687 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 681 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 663 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 587 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 646 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 586 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  38.36 
 
 		 690 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  36.9 
 
 		 530 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 650 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  34.41 
 
 		 601 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  33.33 
 
 		 599 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.31 
 
 		 585 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 658 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 927 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  46.15 
 
 		 560 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 693 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  26.15 
 
 		 299 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  34.69 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 693 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 690 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 692 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 692 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  43.06 
 
 		 1979 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.83 
 
 		 576 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 		 836 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.99 
 
 		 1694 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 878 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2046  tetratricopeptide protein  37.31 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000249019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.67 
 
 		 1007 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.98 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 591 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  35.8 
 
 		 1013 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 632 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 3560 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.56 
 
 		 810 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  51.02 
 
 		 291 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 691 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  36.23 
 
 		 715 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>