More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0222 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  90.95 
 
 		 241 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  69.26 
 
 		 232 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  68.83 
 
 		 231 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  69.7 
 
 		 231 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  67.53 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  63.09 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  64.14 
 
 		 239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  63.09 
 
 		 239 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.55 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  62.71 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  62.66 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  60.85 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  62.34 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  60.61 
 
 		 231 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  58.01 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 		 231 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  60.43 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  51.29 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  50.65 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  50.65 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  51.08 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.26 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  50.64 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  48.15 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.41 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  46.8 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  48.35 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  46.22 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.71 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  48.29 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  47.41 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  48.29 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  50.95 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.91 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  51.67 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  48.2 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.23 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  49.29 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.23 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  49.05 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  49.05 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.27 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  46.7 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  50.94 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  43.33 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.82 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.22 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  42.8 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.26 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  45.02 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  45.8 
 
 		 536 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  47.75 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  49.07 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.18 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  45.57 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  48.36 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  48.36 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  43.97 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  47.51 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  44.07 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>