101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1883 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  100 
 
 		 374 aa  765    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  53.08 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.34 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.72 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  21.69 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  20.21 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  21.13 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.25 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  21.87 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  20.54 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  21.05 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  21.04 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  21.91 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.3 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  19.09 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  21.37 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.09 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  20.87 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  20.87 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.89 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  19.48 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  20.3 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  19.47 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 321 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  21.53 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  25.37 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  24.09 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  23.08 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  21.22 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  21.22 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  19.15 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  24.2 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  24.2 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.68 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  22.17 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  20.99 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  24.14 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  34.92 
 
 		 128 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  22.17 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 187 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  22.27 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  20.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  24.14 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  35.48 
 
 		 578 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  39.06 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  26.49 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 175 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.3 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  34.92 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>