99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0520 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  304  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  304  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  67.31 
 
 
169 aa  206  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  64.74 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  42.48 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
175 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  38.03 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  33.56 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  35.58 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  31.37 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  32.33 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  34.29 
 
 
184 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
183 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
203 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  27.21 
 
 
161 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 
137 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  27.96 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  31.71 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  33.33 
 
 
197 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  21.71 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  21.71 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.69 
 
 
304 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  30.18 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
151 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  26.77 
 
 
195 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 
152 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  29.52 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  37.84 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
200 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  42.55 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  25.69 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  30 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  21.98 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>