More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3303 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 1098 aa  2259    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  40.91 
 
 		 670 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.45 
 
 		 795 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.93 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 878 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.58 
 
 		 1507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.18 
 
 		 810 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 909 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.01 
 
 		 816 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 		 1424 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.51 
 
 		 706 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.92 
 
 		 632 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.91 
 
 		 725 aa  117  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.31 
 
 		 1328 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 		 1056 aa  108  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.69 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1215 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.73 
 
 		 1044 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 637 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 543 aa  101  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 988 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  31.69 
 
 		 909 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 685 aa  97.8  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 362 aa  97.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 3145 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.8 
 
 		 865 aa  95.5  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 927 aa  94.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 1056 aa  94  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 454 aa  94  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.04 
 
 		 462 aa  92.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 583 aa  91.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 612 aa  91.3  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 911 aa  91.3  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 		 784 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1022 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 725 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  32.79 
 
 		 894 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 		 784 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.94 
 
 		 587 aa  88.2  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 602 aa  88.2  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 818 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1105 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 739 aa  87.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  25.53 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  31.94 
 
 		 472 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 924 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.24 
 
 		 395 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  34.41 
 
 		 888 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1276 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.13 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.61 
 
 		 603 aa  83.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.48 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  30.7 
 
 		 476 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.31 
 
 		 799 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1039 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 4489 aa  82.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 885 aa  81.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 505 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  23.75 
 
 		 349 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 808 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 1737 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 		 3301 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.6 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 		 771 aa  78.2  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 718 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1421 aa  78.2  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 762 aa  77.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 3172 aa  77.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.7 
 
 		 2401 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1094 aa  76.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.74 
 
 		 416 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 750 aa  73.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3035 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.51 
 
 		 875 aa  72.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 991 aa  72  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 828 aa  72  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 833 aa  72  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 740 aa  72  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  25.41 
 
 		 902 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.7 
 
 		 545 aa  71.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.49 
 
 		 573 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 		 626 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 649 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 714 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>