104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3474 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  48.04 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 412 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 412 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 412 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 317 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.49 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  33.65 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  35.38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 309 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  25.82 
 
 		 232 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 208 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 425 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>