More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2857 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  65.48 
 
 		 700 aa  861    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 701 aa  1424    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  55.26 
 
 		 695 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  55.75 
 
 		 680 aa  756    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  70.57 
 
 		 694 aa  984    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  55.21 
 
 		 696 aa  689    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  54.18 
 
 		 689 aa  796    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  54.99 
 
 		 691 aa  725    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  43.69 
 
 		 703 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 699 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  42.94 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 700 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 		 698 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 698 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 700 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 707 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 707 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.55 
 
 		 701 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 683 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  43.74 
 
 		 705 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 677 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  39.97 
 
 		 707 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 677 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  43.47 
 
 		 677 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 713 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 677 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  42.16 
 
 		 680 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 676 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 679 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 685 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  42.77 
 
 		 687 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 		 702 aa  462  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 706 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 677 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 730 aa  445  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 		 684 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 730 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.6 
 
 		 678 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 		 726 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 729 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 729 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 653 aa  353  8e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 		 698 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 657 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 657 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  33.38 
 
 		 705 aa  333  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 705 aa  331  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 682 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  34.53 
 
 		 688 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  33.11 
 
 		 706 aa  326  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 705 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 705 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 705 aa  316  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 684 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 705 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 690 aa  311  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  34.42 
 
 		 664 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 715 aa  281  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 571 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  33.41 
 
 		 413 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 		 413 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  39.23 
 
 		 259 aa  169  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 		 260 aa  157  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.55 
 
 		 260 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 261 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 261 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.22 
 
 		 261 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.07 
 
 		 260 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 		 260 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.17 
 
 		 260 aa  148  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  36.29 
 
 		 265 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 		 260 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.79 
 
 		 260 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 257 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.03 
 
 		 265 aa  144  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 258 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 		 265 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 		 265 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 261 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 261 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 261 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 261 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 261 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 254 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 266 aa  138  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 		 257 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 276 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 		 262 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>