More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2584 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  45.74 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1307  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.01 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  34.59 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  46.55 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
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NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
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NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
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NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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