More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1974 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1974  transcription factor CarD  100 
 
 		 988 aa  1971    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0348295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1621  transcription factor CarD  73.36 
 
 		 987 aa  1414    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.300708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0545  transcription factor CarD  54.9 
 
 		 1041 aa  1033    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  42.62 
 
 		 1183 aa  635  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  41.84 
 
 		 1183 aa  609  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  45.33 
 
 		 1123 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  43.77 
 
 		 1176 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1196 aa  598  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  42.92 
 
 		 1197 aa  595  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  41.31 
 
 		 1178 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  41.66 
 
 		 1165 aa  595  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  41.09 
 
 		 1170 aa  595  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  41.74 
 
 		 1169 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1141 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1073 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1150 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  40.59 
 
 		 1197 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1176 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 		 1179 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  39.79 
 
 		 1155 aa  572  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  45.48 
 
 		 1246 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  40.36 
 
 		 1177 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  42.03 
 
 		 1148 aa  572  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1162 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  42.03 
 
 		 1165 aa  572  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  40.39 
 
 		 1169 aa  568  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  40.93 
 
 		 1177 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1178 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  44.85 
 
 		 1182 aa  566  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  41.88 
 
 		 1154 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.62 
 
 		 1162 aa  566  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  37.61 
 
 		 1162 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  38.81 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  41.72 
 
 		 1148 aa  561  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  39.89 
 
 		 1168 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  39.89 
 
 		 1168 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  42.96 
 
 		 1168 aa  562  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  44.31 
 
 		 1147 aa  559  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  40.27 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  44.7 
 
 		 1165 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  47.52 
 
 		 1265 aa  559  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  42 
 
 		 1207 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  43.17 
 
 		 1210 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  41.58 
 
 		 1174 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  43.79 
 
 		 1218 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  43.68 
 
 		 1159 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  44.17 
 
 		 1182 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  43.52 
 
 		 1208 aa  549  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  42.25 
 
 		 1164 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  48.63 
 
 		 1054 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  40.87 
 
 		 1169 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  43.16 
 
 		 1188 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  41.39 
 
 		 1161 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  42.67 
 
 		 1158 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  42.04 
 
 		 1216 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  41.86 
 
 		 1176 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  42.18 
 
 		 1218 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  42.5 
 
 		 1224 aa  549  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  42.52 
 
 		 1157 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  41.19 
 
 		 1150 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1112 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  42.78 
 
 		 1157 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5808  transcription-repair coupling factor  44.33 
 
 		 1351 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294236  normal  0.50078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  46.39 
 
 		 1153 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  40.88 
 
 		 1179 aa  544  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  35.06 
 
 		 1059 aa  541  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  43.92 
 
 		 1157 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  43.78 
 
 		 1157 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  42.3 
 
 		 1177 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  41.26 
 
 		 1157 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1165 aa  538  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  44.04 
 
 		 1234 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  46.07 
 
 		 1188 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  34.54 
 
 		 1120 aa  539  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0898  transcription-repair coupling factor  39.44 
 
 		 1214 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  38.54 
 
 		 1143 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1617  transcription-repair coupling factor  41.58 
 
 		 1147 aa  539  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.89425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  44.32 
 
 		 1192 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0064  transcription-repair coupling factor  41.86 
 
 		 1201 aa  539  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862894  normal  0.0454923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  43.48 
 
 		 1168 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  47.51 
 
 		 1241 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  41.9 
 
 		 1148 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.26 
 
 		 1179 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4468  transcription-repair coupling factor  47.34 
 
 		 1241 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  41.9 
 
 		 1148 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  46.91 
 
 		 1229 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  42.6 
 
 		 1150 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  41.9 
 
 		 1148 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  36.86 
 
 		 1103 aa  534  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  45.14 
 
 		 1212 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  42.51 
 
 		 1168 aa  536  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  45.67 
 
 		 1112 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>