More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0735 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  58.55 
 
 		 187 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  37.06 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.83 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.17 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>