More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1788 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  67.61 
 
 		 256 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  56.81 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.6 
 
 		 252 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.15 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  51.63 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  48.79 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 		 325 aa  244  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 		 318 aa  244  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.43 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  46.5 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.43 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.28 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.64 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.45 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.67 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  40.96 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  40.68 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.6 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.33 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.5 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.3 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  39.69 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  39.69 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.3 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.09 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  40.23 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.39 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.2 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  40.31 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  37.12 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  34.78 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  41.74 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.07 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  37.23 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.05 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  39 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  36.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.25 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.36 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.3 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.13 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 		 249 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.72 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  37.23 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  39.38 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.44 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.44 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.44 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.78 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.62 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  37.35 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.69 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  35.32 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.26 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.21 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  33.62 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>