More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1348 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 888 aa  1781    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  41.99 
 
 		 753 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  70.24 
 
 		 630 aa  301  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.36 
 
 		 582 aa  251  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1363 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.44 
 
 		 351 aa  141  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 904 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  30.92 
 
 		 906 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 2072 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  25.64 
 
 		 1079 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.51 
 
 		 1535 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 449 aa  125  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 		 1134 aa  125  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 813 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 1358 aa  121  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1557 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1050 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1516 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 899 aa  118  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  26.68 
 
 		 1379 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1938  PAS/PAC domain-containing protein  25.99 
 
 		 632 aa  115  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 906 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1439 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 1061 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 955 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 1267 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 		 793 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  29.56 
 
 		 445 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  29.59 
 
 		 378 aa  111  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 909 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1222 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 608 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.22 
 
 		 1785 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 1177 aa  110  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  26.06 
 
 		 603 aa  110  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 849 aa  109  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.101601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1075 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 1111 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 1246 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 		 1116 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 659 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 1399 aa  107  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 3706 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 873 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 856 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 943 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 775 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.97 
 
 		 1021 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 1426 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 		 340 aa  105  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 921 aa  105  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 		 479 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 1069 aa  104  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.96 
 
 		 518 aa  104  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  28.53 
 
 		 1258 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 953 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 		 946 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1120 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  27.66 
 
 		 770 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 821 aa  103  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 981 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 1291 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.48 
 
 		 1258 aa  102  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 673 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 		 1791 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 807 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.3 
 
 		 960 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 686 aa  102  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 		 692 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 510 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1596 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  25 
 
 		 1062 aa  102  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  28.05 
 
 		 917 aa  101  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.98 
 
 		 878 aa  101  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 1648 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 1758 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 845 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1741 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 1333 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  27.94 
 
 		 412 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.72 
 
 		 896 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1148 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 		 1261 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 1390 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.3 
 
 		 933 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292591  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 		 1124 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 		 883 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 659 aa  99.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.43 
 
 		 1078 aa  99.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 473 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2535  putative PAS/PAC sensor protein  22.91 
 
 		 468 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.993201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26 
 
 		 1143 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26 
 
 		 1143 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1333 aa  99  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 		 1122 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 793 aa  98.2  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 845 aa  98.2  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>