91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5385 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  100 
 
 		 599 aa  1206    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  36.63 
 
 		 509 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  38.94 
 
 		 563 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  39.25 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  36.24 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  36.5 
 
 		 538 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  37.05 
 
 		 529 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  38.7 
 
 		 529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  35.02 
 
 		 310 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  36.12 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  33.14 
 
 		 558 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  33.23 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  32.89 
 
 		 567 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  28.75 
 
 		 560 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.55 
 
 		 566 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  24.83 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.42 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.85 
 
 		 687 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  32.11 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  29.35 
 
 		 401 aa  90.5  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 538 aa  90.1  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.79 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  31.18 
 
 		 564 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  29.06 
 
 		 602 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  27.12 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  26.25 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  30.95 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.95 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  27.31 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  24.37 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  23.06 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  31.03 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.8 
 
 		 588 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  28.29 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  30.31 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.72 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  24.81 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  22.88 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  23.31 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.91 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.69 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.27 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  30.68 
 
 		 588 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.92 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.67 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.26 
 
 		 436 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  24.58 
 
 		 329 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.48 
 
 		 400 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  22.47 
 
 		 430 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  23.88 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  21.52 
 
 		 430 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 499 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  25.1 
 
 		 602 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  23.25 
 
 		 529 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  22.98 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  22.98 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  22.6 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4798  phage integrase family protein  23.42 
 
 		 331 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.586427 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.44 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0436  hypothetical protein  32.97 
 
 		 99 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 568 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  33.33 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  27.2 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.85 
 
 		 508 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.85 
 
 		 508 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  23.53 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  22.05 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  26.48 
 
 		 565 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  23.91 
 
 		 548 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  21.03 
 
 		 326 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  24.81 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.06 
 
 		 352 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  25.95 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  22.29 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  23.48 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  25.08 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  27.07 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  27.16 
 
 		 415 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 687 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.81 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2987  putative site specific integrase  28.32 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  24.48 
 
 		 323 aa  44.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.74 
 
 		 391 aa  44.3  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  27.27 
 
 		 471 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>