More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3208 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  80.33 
 
 		 255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  77.37 
 
 		 246 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  75.1 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  74.17 
 
 		 252 aa  357  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  71.19 
 
 		 252 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  70.46 
 
 		 241 aa  339  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  70.04 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  69.2 
 
 		 241 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  64.58 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  64.32 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  64.32 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.33 
 
 		 242 aa  321  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  64.32 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  63.56 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  63.49 
 
 		 244 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.29 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  63.11 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  63.37 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  62.7 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  62.55 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  62.55 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  61 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.33 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  60.33 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  63.45 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  59.34 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 247 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59.36 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  58.51 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  58.78 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  60.43 
 
 		 506 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  59.17 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.02 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  58.33 
 
 		 248 aa  288  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  56.78 
 
 		 239 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.23 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.23 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  57.72 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.08 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  57.92 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 267 aa  274  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.79 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.68 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  61.6 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.12 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.88 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  50.39 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  59.75 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  54.22 
 
 		 265 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.72 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  56.85 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.04 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  58.37 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  56.3 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  56.38 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  57.42 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  54.66 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  53.01 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.63 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.62 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  55.19 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.88 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.75 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  55.92 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  57.55 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  54.84 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.32 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.17 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  57.81 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  52.63 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.97 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.6 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.75 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.94 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>