More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2628 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  64.99 
 
 		 692 aa  871    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 693 aa  1382    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  71.43 
 
 		 700 aa  989    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  63.44 
 
 		 699 aa  836    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.51 
 
 		 710 aa  864    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  46.64 
 
 		 675 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.9 
 
 		 683 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  48.28 
 
 		 673 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.96 
 
 		 668 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.94 
 
 		 670 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 668 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 670 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.1 
 
 		 671 aa  532  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  46.21 
 
 		 685 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.73 
 
 		 690 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.54 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.25 
 
 		 670 aa  528  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.41 
 
 		 672 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  45.87 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  45.62 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  45.89 
 
 		 678 aa  524  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  44.55 
 
 		 671 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.27 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 662 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  45.79 
 
 		 669 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 672 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  44.43 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 		 678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.94 
 
 		 674 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44.09 
 
 		 690 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.79 
 
 		 670 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  43.53 
 
 		 685 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  37.97 
 
 		 662 aa  514  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  43.94 
 
 		 690 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 677 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  43.73 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 685 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  44.51 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 685 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  40.69 
 
 		 663 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  44.73 
 
 		 675 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.48 
 
 		 670 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.09 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.29 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  44.08 
 
 		 670 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  43.7 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 677 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 681 aa  505  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  44.16 
 
 		 668 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  43.49 
 
 		 670 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  41.47 
 
 		 673 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  46 
 
 		 693 aa  502  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  43.09 
 
 		 673 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  42.5 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.22 
 
 		 672 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  43.45 
 
 		 666 aa  492  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.54 
 
 		 669 aa  492  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.15 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.15 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.15 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 682 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  42.54 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 		 672 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  43.08 
 
 		 721 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.98 
 
 		 684 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  43.76 
 
 		 694 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  43.98 
 
 		 681 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 671 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.34 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  44.33 
 
 		 677 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 671 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.94 
 
 		 669 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.34 
 
 		 671 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.34 
 
 		 670 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.32 
 
 		 681 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.09 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.32 
 
 		 681 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.2 
 
 		 671 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 672 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  43.64 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.2 
 
 		 671 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.25 
 
 		 682 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  38.53 
 
 		 662 aa  482  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.32 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 695 aa  482  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  41.38 
 
 		 681 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  43.45 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  43.34 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  43.2 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>