More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0635 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  54.94 
 
 
627 aa  637    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  100 
 
 
622 aa  1222    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  57.36 
 
 
623 aa  681    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  57.49 
 
 
618 aa  607  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  45.27 
 
 
616 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  42.46 
 
 
597 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  41.21 
 
 
596 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  41.05 
 
 
596 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 
596 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  39.97 
 
 
602 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  38.97 
 
 
588 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.63 
 
 
588 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.61 
 
 
605 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.61 
 
 
605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  34.58 
 
 
609 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  36.81 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  34.41 
 
 
601 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.41 
 
 
605 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  35.28 
 
 
593 aa  310  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.28 
 
 
624 aa  304  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.83 
 
 
592 aa  303  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.95 
 
 
602 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.55 
 
 
598 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.08 
 
 
588 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.34 
 
 
602 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.37 
 
 
592 aa  298  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.1 
 
 
592 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.18 
 
 
602 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.27 
 
 
588 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  34.22 
 
 
606 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.3 
 
 
609 aa  293  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.01 
 
 
606 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.44 
 
 
592 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.62 
 
 
613 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.32 
 
 
612 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  32.89 
 
 
602 aa  287  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.98 
 
 
592 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.37 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 
592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.83 
 
 
588 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.44 
 
 
592 aa  280  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.9 
 
 
588 aa  280  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33.44 
 
 
592 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
592 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 
607 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.75 
 
 
591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.22 
 
 
589 aa  275  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.52 
 
 
609 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.36 
 
 
589 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.66 
 
 
599 aa  272  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  32.3 
 
 
609 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 
605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 
588 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.97 
 
 
614 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.95 
 
 
608 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
590 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.71 
 
 
581 aa  263  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.09 
 
 
619 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  32.15 
 
 
609 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.76 
 
 
594 aa  262  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  29.5 
 
 
593 aa  260  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  31.35 
 
 
590 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.55 
 
 
609 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  31.55 
 
 
609 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
593 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  31.35 
 
 
619 aa  257  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  30.63 
 
 
588 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.1 
 
 
588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  31.67 
 
 
610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.31 
 
 
587 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 
591 aa  253  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  31.51 
 
 
610 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.23 
 
 
591 aa  250  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 
588 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  32.98 
 
 
590 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.82 
 
 
618 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.14 
 
 
632 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.13 
 
 
622 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.63 
 
 
599 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  30.79 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.77 
 
 
610 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.43 
 
 
619 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.77 
 
 
630 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.77 
 
 
610 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.22 
 
 
593 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.87 
 
 
641 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.6 
 
 
620 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 
587 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  31.18 
 
 
604 aa  240  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.85 
 
 
616 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.3 
 
 
608 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  28.82 
 
 
593 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  28.73 
 
 
611 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 
591 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  28.78 
 
 
590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.36 
 
 
610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.5 
 
 
605 aa  234  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.04 
 
 
613 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.49 
 
 
634 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>