More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15730 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  50.63 
 
 		 812 aa  718    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  100 
 
 		 706 aa  1428    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  46.56 
 
 		 792 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  50.63 
 
 		 806 aa  721    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  50 
 
 		 788 aa  705    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  50.78 
 
 		 808 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  50.92 
 
 		 804 aa  722    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  50.63 
 
 		 810 aa  719    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  51.63 
 
 		 722 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  50.78 
 
 		 808 aa  721    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  50.78 
 
 		 757 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  50.35 
 
 		 814 aa  714    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  47.25 
 
 		 759 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  50.63 
 
 		 806 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  50.78 
 
 		 808 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  52.13 
 
 		 758 aa  749    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  51.55 
 
 		 709 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  48.94 
 
 		 770 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  49.93 
 
 		 716 aa  698    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  51.77 
 
 		 762 aa  745    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  46.56 
 
 		 790 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  49.79 
 
 		 706 aa  697    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  50.28 
 
 		 792 aa  716    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  46.56 
 
 		 790 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  49.44 
 
 		 751 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  49.44 
 
 		 751 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  49.72 
 
 		 715 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  48.45 
 
 		 903 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  50.78 
 
 		 806 aa  719    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  45.95 
 
 		 763 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  46.27 
 
 		 763 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  46.86 
 
 		 716 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  44.35 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  43.94 
 
 		 752 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  44.76 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  44.62 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  42.72 
 
 		 737 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  40.2 
 
 		 709 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  39.89 
 
 		 818 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  43 
 
 		 737 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  41.8 
 
 		 810 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  41.53 
 
 		 722 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  40 
 
 		 937 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  41.33 
 
 		 735 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  42.11 
 
 		 777 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  39.86 
 
 		 801 aa  523  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  41.52 
 
 		 755 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  37.95 
 
 		 720 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  38.33 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  37.9 
 
 		 750 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  40.4 
 
 		 708 aa  513  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  40.49 
 
 		 857 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  40.47 
 
 		 857 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  41.16 
 
 		 766 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  39.52 
 
 		 840 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  39.41 
 
 		 1055 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  38.82 
 
 		 825 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  39.83 
 
 		 805 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  40.36 
 
 		 857 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  41.18 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  42.17 
 
 		 751 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  40.08 
 
 		 859 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  39.48 
 
 		 876 aa  505  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.81 
 
 		 877 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  40.25 
 
 		 907 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  42.02 
 
 		 704 aa  497  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  39.06 
 
 		 870 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  38.21 
 
 		 828 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  39.69 
 
 		 736 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  39.53 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  39.23 
 
 		 861 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  40.11 
 
 		 906 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  38.21 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  38.21 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  41.4 
 
 		 829 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  38.21 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  39.4 
 
 		 877 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  39.55 
 
 		 749 aa  495  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  39.46 
 
 		 803 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  39.09 
 
 		 817 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  39.19 
 
 		 726 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  39.67 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  37.91 
 
 		 895 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  38.34 
 
 		 801 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  38.4 
 
 		 817 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  38.4 
 
 		 817 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  41.67 
 
 		 817 aa  490  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  37.5 
 
 		 886 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  37.5 
 
 		 838 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  37.95 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  39.04 
 
 		 726 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  37.5 
 
 		 896 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  37.5 
 
 		 896 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  37.5 
 
 		 838 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  37.75 
 
 		 833 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  41.87 
 
 		 737 aa  487  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  37.89 
 
 		 833 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  38.21 
 
 		 818 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  37.5 
 
 		 838 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  39.82 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>