155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02660 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
191 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  54.39 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  42.35 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  51.92 
 
 
305 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.22 
 
 
289 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  53.85 
 
 
530 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  56.86 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  38.82 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  58.7 
 
 
221 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  55.77 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  55.1 
 
 
567 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  49.15 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
173 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03299  hypothetical protein  42.62 
 
 
338 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 
142 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.33 
 
 
391 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  57.78 
 
 
509 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  51.02 
 
 
338 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.53 
 
 
402 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.35 
 
 
192 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  48.94 
 
 
426 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.44 
 
 
376 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
123 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.23 
 
 
335 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  53.06 
 
 
274 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.84 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  48.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
709 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
536 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
590 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  50 
 
 
341 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
411 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 
583 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 
500 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 
128 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  47.27 
 
 
568 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  45.65 
 
 
739 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
466 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  53.19 
 
 
287 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 
754 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  41.67 
 
 
788 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36 
 
 
470 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0689  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  44.07 
 
 
420 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  51.85 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  51.85 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  54.55 
 
 
390 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  30.84 
 
 
184 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  45.65 
 
 
739 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
109 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  35.29 
 
 
419 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  49.02 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  44.83 
 
 
881 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  42 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  47.83 
 
 
423 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
455 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.83 
 
 
422 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
295 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 
302 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
112 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  43.48 
 
 
431 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.58 
 
 
433 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.31 
 
 
727 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 
555 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.31 
 
 
727 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  55.56 
 
 
295 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.79 
 
 
430 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  37.88 
 
 
265 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.9 
 
 
582 aa  44.7  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  46.81 
 
 
475 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  54.76 
 
 
372 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  40.68 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  43.48 
 
 
351 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  46.15 
 
 
372 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  46.15 
 
 
372 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  53.19 
 
 
526 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  43.64 
 
 
1556 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  51.85 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.22 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  38 
 
 
301 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  40.58 
 
 
546 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  37.78 
 
 
330 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.06 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.75 
 
 
824 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  46.67 
 
 
487 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
503 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  38.3 
 
 
390 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
382 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  48.15 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
359 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
382 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 
405 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  48.89 
 
 
509 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>