More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3247 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3247  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 174 aa  351  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405912  normal  0.391395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0937  TPR repeat-containing protein  46.1 
 
 		 279 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376157  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 291 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.57 
 
 		 277 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  42.98 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 681 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 685 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  34.43 
 
 		 545 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 362 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 637 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  39.8 
 
 		 795 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5209  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.290651 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  39.22 
 
 		 587 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 909 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 739 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 762 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.6 
 
 		 725 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 3145 aa  67.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  42.86 
 
 		 473 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.93 
 
 		 816 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  30.3 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 750 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 610 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.04 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 649 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 649 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 646 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 878 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.19 
 
 		 354 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 718 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.69 
 
 		 810 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  41.49 
 
 		 708 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  38.32 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 612 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  36.73 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  29.6 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 706 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.63 
 
 		 603 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  34.26 
 
 		 733 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  35.58 
 
 		 732 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 435 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 689 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.55 
 
 		 462 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 602 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.83 
 
 		 706 aa  60.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 968 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 1450 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.66 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 1252 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 670 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.43 
 
 		 865 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34.95 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 573 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 566 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 4079 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  36.73 
 
 		 395 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 601 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30 
 
 		 582 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 583 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.54 
 
 		 503 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 639 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.67 
 
 		 430 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 471 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.55 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  40.24 
 
 		 695 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 		 330 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1049 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 748 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 808 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  28.97 
 
 		 334 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 615 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  39 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.17 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>