111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3524 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  41.89 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  40.56 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  37.76 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  31.82 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  31.13 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  31.25 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  28.93 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  36.59 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  34.78 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.78 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  32.17 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  28.48 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  42.25 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.41 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  40.51 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  39.44 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  29.31 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  41.43 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  28.68 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.42 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  29.32 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  40 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.34 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  39.06 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  39.71 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  26.53 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  39.51 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  32.09 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  43.64 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  34.09 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  26.03 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.39 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.06 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  45.83 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  28.32 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  37.93 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  40.74 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  34.15 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  36.54 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  37.31 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  37.5 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  26.83 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  26.79 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  39.22 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.7 
 
 		 306 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  41.79 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  34.29 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  35.29 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  35.19 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  34.43 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  26.71 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  52.78 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  41.18 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  27.78 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  34.15 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  23.62 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  32.18 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  62.07 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  27.89 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  25.66 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  40 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  31.67 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  39.13 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  35.29 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.42 
 
 		 152 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 276 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.88 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.14 
 
 		 147 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  29.82 
 
 		 291 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  30.77 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.25 
 
 		 300 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.77 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  31.82 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  32.86 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  25.4 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  27.66 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  33.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>