35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0565 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  53.9 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  48.2 
 
 
143 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  43.57 
 
 
144 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  39.57 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  39.13 
 
 
146 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  39.13 
 
 
141 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  41.43 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  25.71 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  29.79 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  30.77 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  26.62 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  39.47 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  22.95 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  38.04 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.6 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  43.1 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
297 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  43.1 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  43.1 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  43.1 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  43.1 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  43.1 
 
 
191 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  26.67 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  33.93 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  26.96 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  27.27 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  35.53 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  35.53 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
297 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  34.21 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.29 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.96 
 
 
895 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>