10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1214 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  52.71 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  51.94 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  50 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  39.57 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  43.17 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  35.97 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  45.39 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  27.54 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26.17 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>