14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1212 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  53.9 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  46.85 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  45.32 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  45.39 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  42.55 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  40.88 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.29 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  30.5 
 
 		 139 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 543 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.33 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.43 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>