11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0194 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  76.26 
 
 
146 aa  215  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  72.34 
 
 
146 aa  201  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  51.94 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  42.65 
 
 
143 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  39.13 
 
 
144 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  45.32 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  40.3 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.08 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  33.96 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>