15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1884 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  64.29 
 
 
144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  48.2 
 
 
144 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  46.85 
 
 
147 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  42.65 
 
 
141 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  43.17 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  40.15 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  39.26 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.21 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  37.35 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  37.18 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.63 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.51 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  34.62 
 
 
148 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  32.91 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>