166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3020 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  25.9 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.77 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.99 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  38.36 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  27.46 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  26.62 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.09 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.08 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  27.54 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.28 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  32.88 
 
 		 622 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.67 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.14 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 323 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  28.06 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.79 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 284 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.65 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  29.09 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.29 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  29.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  29.5 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 750 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 164 aa  47.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  26.35 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  29.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.5 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  25.97 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 285 aa  47.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  26.43 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.87 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.26 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.24 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.24 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.24 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.22 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.24 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.24 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.13 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  26.24 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  27.08 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  27.39 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.24 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  29.5 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.25 
 
 		 627 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.14 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  23.74 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  24.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  38.57 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  28.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  26.43 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  25.18 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.15 
 
 		 303 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  29.08 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  25.53 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  26.09 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  25.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  26.71 
 
 		 138 aa  43.9  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  25.71 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.66 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.17 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  32.93 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  23.02 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.94 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.88 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  24.76 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  24.76 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>