More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0580 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  57.48 
 
 		 221 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  55.07 
 
 		 216 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  51.85 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  47.39 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  48.31 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  49.07 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  46.92 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  43.41 
 
 		 216 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  50.49 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  51.22 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  51.22 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  47.2 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  47.25 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  51.76 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  43.95 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.7 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  46.05 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  44.98 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  48.04 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  46.89 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  47.17 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  45.77 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  45.1 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  43.52 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  41.92 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  49.22 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  41.94 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.35 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  39.09 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  41.1 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  41.55 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.23 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  35.86 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.13 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  34.88 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.92 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.44 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  41.71 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  40.39 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.52 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  42.6 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  39.51 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  41.53 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  34.93 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  29.52 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.3 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  30 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  31.91 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  33.5 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  35.24 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  42.22 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.53 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  39.89 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  36.26 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.94 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  31.65 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  32.46 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  36.16 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  31.94 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  31.61 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.61 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.33 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.03 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  30.88 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.61 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  43.55 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.69 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  28.72 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.57 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  34.42 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.02 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.19 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  29.33 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  26.51 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.24 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.88 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  26.21 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  27.03 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.85 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  27.56 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  27.56 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.25 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.7 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.86 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.37 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  30.26 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  27.6 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.15 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>